Python操作HDF5文件代码实例
发布时间：2022-07-04 22:01:48 所属栏目：PHP教程 来源：互联网
导读：本篇文章小编给大家分享一下Python操作HDF5文件代码示例，文章代码介绍的很详细，小编觉得挺不错的，现在分享给大家供大家参考，有需要的小伙伴们可以来看看。 创建文件和数据集 使用`h5py.File()方法创建hdf5文件 ? 1 h5file = h5py.File(filename,w) 然
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本篇文章小编给大家分享一下Python操作HDF5文件代码示例，文章代码介绍的很详细，小编觉得挺不错的，现在分享给大家供大家参考，有需要的小伙伴们可以来看看。 创建文件和数据集 使用`h5py.File()方法创建hdf5文件 ? 1 h5file = h5py.File(filename,'w') 然后在此基础上创建数据集 X = h5file.create_dataset(shape=(0,args.patch_size,args.patch_size), #数据集的维度 maxshape = (None,args.patch_size,args.patch_size), #数据集的允许最大维度 dtype=float,compression='gzip',name='train', #数据类型、是否压缩，以及数据集的名字 chunks=(args.chunk_size,args.patch_size,args.patch_size)) #分块存储，每一分块的大小 最为关系的两个参数为shape和maxshape，很显然我们希望数据集的某一个维度是可以扩展的，所以在maxshape中，将希望扩展的维度标记为None，其他维度和shape参数里面的一样。还有一点值得注意的是，使用compression='gzip'以后，整个数据集能够被极大的压缩，对比较大的数据集非常又用，并且在数据读写的时候，不用用户显式的解码。 写数据集 在使用上面的creat_dataset创建了dataset以后，读写数据集就如同读写numpy数组一样方便，比如上面的函数定义了数据集'train'，也就是变量X以后，可以下面的方法来读写： ? 1 2 data = np.zeros((100,args.patch_size,arg)) X[0:100,:,:] = data 在前面创建数据集的时候，我们定义shape = (args.chunk_size,args.patch_size,args.patch_size)，如果有更多的数据，怎么办呢？ 可以使用resize方法来扩展在maxshape中定义为None的那个维度: ? 1 X.resize(X.shape[0]+args.chunk_size,axis=0) 因为我们在maxshape=(None,args.patch_size,args.patch_size)中将第零个维度定义为可扩展，所以，首先我们用X.shape[0]来找到该维度的长度，并将其扩展。该维度扩展以后，就可以继续向里面写入数据了。 读数据集 读取h5文件的方法也非常简单，首先利用h5py.File方法打开对应的h5文件，然后将里面的某个数据集取出至变量，对这个变量的读取就如同numpy一样了。 h = h5py.File(hd5file,'r') train = h['train'] train[1] train[2] ... 但是上面的读取方法存在一个问题就是每一次使用的时候(train[1],train[2])都需要从硬盘读取数据，这将会导致读取的速度比较慢。一个比较好的方法是，每次从硬盘读取一个chunk_size的数据，然后将这些数据存储到内存中，在需要的时候从内存中读取，比如使用下面的方法： h = h5py.File(hd5file,'r') train = h['train'] X = train[0:100] #一次从硬盘中读取比较多的数据，X将存储在内存中 X[1] #从内存中读取 X[2] #从内存中读取 这样的方法就会快很多。 （编辑：PHP编程网 - 黄冈站长网） 【声明】本站内容均来自网络，其相关言论仅代表作者个人观点，不代表本站立场。若无意侵犯到您的权利，请及时与联系站长删除相关内容! |
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